Monograf Menggagas Harapan Baru: Peptida Ikan Gabus sebagai Pemusnah Kanker

Abstract

Ikan gabus adalah ikan yang tersebar luas di Kalimantan. Ikan gabus (Channa striata) merupakan ikan air tawar yang banyak dimanfaatkan pada bidang kesehatan dan farmasi yang digunakan sebagai obat karena kandungan yang dimilikinya telah terbukti secara klinis pada beberapa penyakit. Salah satu komponen utama ikan gabus adalah protein. Protein mengandung peptida aktif yang mempunyai peran kesehatan. Penelitian dalam buku ini bertujuan untuk melakukan skrining virtual peptida aktif dari protein myosin ikan gabus (Channa striata) dan mempelajari interaksi peptida aktif dengan protein Epidermal Factor Growth Receptor (EFGR) dengan molecular docking. Protein Epidermal Factor Growth Receptor (EFGR) adalah protein penting yang berpengaruh pada pertumbuhan kanker. Skrining virtual menggunakan beberapa web server antara lain Uniprot, PeptidaCutter, BIOPEP-UWM, Innovagen AB, AllerTOP, ToxinPred, SwissDock dan SwissADME. Hasil skrining virtual menunjukkan bahwa beberapa peptida aktif berpotensi sebagai antikanker antara lain: 6 dipeptida yaitu EA, IR, QK, QK, QR dan AK, 2 tripeptida yaitu VIQ dan AER dan 4 oligopeptida yaitu DTSK, SPEEK, TPEEK dan EEQAEPDGTEAAD. Hasil akhir dari proses docking molekul menunjukkan bahwa peptide AK (alanillysine) dengan protein EFGR (PDB ID: 6Z4D) menghasilkan nilai energi ikatan (ΔG) sebesar -9.72 kkal/mol dan residu asam amino pada ikatan hidrogen berupa Lys-716, Asp-800 dan Glu-804 (2 ikatan) dan ikatan hidrofobik berupa Val-717, Ser-720, Glu-804, Tyr-801, His-805, Pro-794 dan Phe-795. Peptida AK secara in silico memiliki potensi sebagai obat anti-kanker dengan peran sebagai penghambat protein EFGR.